Ponowna reakcja na kryzotynib za pomocą Lorlatinibu ALK Resistance Mutation L1198F ad 5

Wykryliśmy podwójną mutację (ALK C1156Y-L1198F) w próbce opornej na lorlatinib i pojedynczą mutację ALK C1156Y w próbce opornej na krizotynib. ALK C1156Y wykryto również przy niskiej częstotliwości w nowotworze przed leczeniem. Frakcja komórek nowotworowych niosących ALK C1156Y wynosiła mniej niż 7% w guzie przed leczeniem, około 50% w guzie opornym na kryzotynib i około 100% w guzie opornym na lloratynib. Mutację ALK L1198F wykrywano tylko w próbce opornej na lloratynib. Analiza klonów sugerowała, że przed poddaniem krizotynibowi istniał subklon o niższym C1156Y. Ten subklon został wzbogacony podczas leczenia kryzotynibem, a następnie wyewoluowany w celu uzyskania mutacji L1198F pod selektywnym ciśnieniem lorlatinibu (Figura 1E i Fig. Po tym, jak pacjent otrzymał odpowiedź na kryzotynib po raz drugi, wystąpił nawrót i otrzymano inną próbkę biopsji. Continue reading „Ponowna reakcja na kryzotynib za pomocą Lorlatinibu ALK Resistance Mutation L1198F ad 5”

Ponowna reakcja na kryzotynib za pomocą Lorlatinibu ALK Resistance Mutation L1198F czesc 4

Wszystkie biopsje i testy molekularne przeprowadzono zgodnie z protokołami zatwierdzonymi przez instytucjonalną komisję rewizyjną w Massachusetts General Hospital. Badania genetyczne
Badania przesiewowe pod kątem rearanżacji ALK i amplifikacji protoonkogenu MET (MET) przeprowadzono przy użyciu fluorescencyjnej hybrydyzacji in situ (FISH), jak opisano wcześniej.10,18 mutacje oporności na ALK zidentyfikowano za pomocą ukierunkowanej następnej generacji sekwencjonowanie (NGS) assay19 i Sanger sekwencjonowanie komplementarnego DNA. Sekwencjonowanie całego egzaminu przeprowadzono zgodnie z opisem w dodatkowym dodatku, dostępnym wraz z pełnym tekstem tego artykułu pod adresem.
Badania linii komórek Ba / F3
Komórki Ba / F3 poddano obróbce w celu ekspresji związanego z mikrotubulami białka podobnego do mikrotubuli 4 (EML4) -ALK niosącego różne mutacje oporności na ALK. Testy przeżycia komórek przeprowadzono jak opisano wcześniej.13
Badania biochemiczne i strukturalne
Szczegóły metod oznaczania stałych hamowania Ki, charakterystyki kinetyczne i struktury ko-kryształów podano w Dodatku uzupełniającym. Struktury ko-kryształów zostały zdeponowane w Banku Światowych Danych Białkowych (identyfikatory 5A9U, 5AA8, 5AA9, 5AAA, 5AAB i 5AAC).
Wyniki
Analiza genetyczna odpornych próbek nowotworowych
Aby zidentyfikować mechanizm oporności u tego pacjenta, uzyskaliśmy próbkę biopsji zmiany wątroby, która powiększała się, podczas gdy pacjent przyjmował lorlatinib, abyśmy mogli wykonać testy molekularne. Continue reading „Ponowna reakcja na kryzotynib za pomocą Lorlatinibu ALK Resistance Mutation L1198F czesc 4”

Ponowna reakcja na kryzotynib za pomocą Lorlatinibu ALK Resistance Mutation L1198F cd

W trakcie nawrotu lorlatinibu choroba w końcu powróciła, ale ponownie otrzymała odpowiedź na kryzotynib. Opisujemy molekularne podstawy oporności na lorlatinib i reaktywację na kryzotynib u tego pacjenta. Opis przypadku
52-letnia kobieta z przerzutowym NSCLC z rearanżacją ALK otrzymywała krizotynib w pierwszej linii i uzyskała klinicznie istotną odpowiedź trwającą 18 miesięcy. Tomografia komputerowa (CT) w tym czasie ujawniła nową limfadenopatię brzuszną. Przeszła biopsję węzła chłonnego, który powiększał się podczas przyjmowania kryzotynibu; próbka biopsyjna wykazała mutację ALK C1156Y oporną na krizotynib.17 Crizotinib przerwano, a ona zaczęła otrzymywać certynib. Pierwsze restytucyjne skany CT w 5 tygodniu wykazywały postępującą chorobę z licznymi nowymi przerzutowymi zmianami w wątrobie. Następnie otrzymała inhibitor białka szoku termicznego 90 (HSP90) (AUY922) i szybko pogarszała się choroba. Continue reading „Ponowna reakcja na kryzotynib za pomocą Lorlatinibu ALK Resistance Mutation L1198F cd”

Skrócenie Titin powodujące rozdęta kardiomiopatia AD 6

Spośród 32 członków rodziny, którzy mieli więcej niż 40 lat i dla których dane były dostępne, penetracja mutacji tnących TTN była większa niż 95%. Warianty łączone Zidentyfikowaliśmy 17 wariantów TTN u 19 pacjentów z rozszerzoną kardiomiopatią, która prawdopodobnie zmieni splicing RNA, w tym 11, które zmieniły całkowicie zachowane nukleotydy miejsca składania (Tabela i Tabela 7 w Dodatku Dodatkowym). Sekwencjonowanie RNA próbek tkanek serca od dwóch osobników z wariantami składania (jedno dziecko dorosłe z małżeńskiego małżeństwa z wariantem homozygotycznego splicingu [dane nie pokazane], drugie opisane na Fig. 3 w Dodatkowym dodatku) potwierdziło nieprawidłowe łączenie TTN. Continue reading „Skrócenie Titin powodujące rozdęta kardiomiopatia AD 6”

Wynik pediatryczny po rozpoznaniu raka sutka w czasie ciąży czesc 4

Wszystkie pomiary echokardiograficzne uzyskano w trzech cyklach kardiologicznych i uśredniono. W razie potrzeby pomiary korygowano dla pola powierzchni ciała i obliczono wartości z. Niezależne próbki t-testów wykorzystano do porównania pomiarów echokardiograficznych i punktów z w dwóch badanych grupach. Dwustronna wartość P mniejsza niż 0,05 została uznana za wskazującą istotność statystyczną dla wszystkich analiz. Do sześciu znaczących wyników można się było spodziewać na podstawie przypadku, biorąc pod uwagę plan wykonania 110 analiz podgrup.
Wyniki
Charakterystyka dzieci
Tabela 1. Tabela 1. Continue reading „Wynik pediatryczny po rozpoznaniu raka sutka w czasie ciąży czesc 4”

Wynik pediatryczny po rozpoznaniu raka sutka w czasie ciąży cd

Od 2012 r. Do 2015 r. Dzieci z obu grup zostały zaproszone do udziału w 18 miesięcy i 36 miesiącach. W przypadku dzieci, które były testowane zarówno w ciągu 18 miesięcy, jak i 36 miesięcy, uwzględniliśmy tylko jeden wynik (ten, dla którego dostępna była dopasowana kontrola) w analizie. We wszystkich badanych dzieciach przeprowadzono kliniczne neurologiczne i ogólne badania pediatryczne, a rodzice wypełnili kwestionariusz zdrowotny (patrz rozdział Metody w dodatkowym dodatku). Oceniliśmy rozwój poznawczy dzieci w obu grupach za pomocą skali Bayleya rozwoju niemowląt. Standardowe wyniki w tym teście wynoszą od 50 do 150, przy czym wyższe wyniki wskazują na bardziej zaawansowany rozwój; średni wynik (. Continue reading „Wynik pediatryczny po rozpoznaniu raka sutka w czasie ciąży cd”

Wynik pediatryczny po rozpoznaniu raka sutka w czasie ciąży ad

Nasze wstępne dane zdawały się sugerować, że ekspozycja płodu na leczenie raka u matki nie była związana z zaburzeniami poznawczymi lub sercowymi.8 Połączony retrospektywny i prospektywny projekt ograniczał interpretację wyników, ponieważ wyniki z różnych testów w różnym wieku (16,8 miesięcy do 17,6 lat) zostały połączone. Dlatego rozszerzyliśmy prospektywną kohortę tak, aby obejmowała tylko osoby we wczesnym dzieciństwie (12 do 42 miesięcy) i oceniła ogólny stan zdrowia, wzrost, rozwój poznawczy oraz strukturę i funkcję serca, a także porównała wyniki z wynikami dla dzieci w dopasowanej grupie kontrolnej. . Metody
Uczestnicy badania
Rycina 1. Rycina 1. Projekt badania i rekrutacja 129 dzieci z grupy prenatalnej, które zostały ocenione w ostatecznej analizie, objęło 98 dzieci, które przeszły nowe badania za pomocą skali Bayley Scales of Infant Development i 31 dzieci, u których uzyskano wyniki. opublikowane wcześniej. Continue reading „Wynik pediatryczny po rozpoznaniu raka sutka w czasie ciąży ad”

Wynik pediatryczny po rozpoznaniu raka sutka w czasie ciąży

Brakuje danych na temat odległych wyników dzieci, które są narażone na raka sutka z lub bez leczenia w czasie ciąży. Metody
W tym wieloośrodkowym badaniu kliniczno-kontrolnym porównaliśmy dzieci, których matki otrzymały diagnozę raka podczas ciąży z dobranymi dziećmi kobiet bez rozpoznania raka. Użyliśmy kwestionariusza zdrowia i dokumentacji medycznej do zebrania danych dotyczących stanu noworodków i ogólnego stanu zdrowia. Wszystkie dzieci oceniano prospektywnie (za pomocą badania neurologicznego i skali Bayleya rozwoju niemowląt) po 18 miesiącach, 36 miesiącach lub w obu przypadkach. Ocenę kardiologiczną wykonano po 36 miesiącach.
Wyniki
Łącznie 129 dzieci (średni wiek, 22 miesiące, zakres od 12 do 42) było włączonych do grupy, której matka miała raka (grupa ekspozycji prenatalnej) z odpowiednią liczbą w grupie kontrolnej. W czasie ciąży 96 dzieci (74,4%) było narażonych na chemioterapię (samodzielnie lub w połączeniu z innymi terapiami), 11 (8,5%) na radioterapię (samodzielnie lub w połączeniu), 13 (10,1%) z samą operacją, 2 (1,6% ) do innych leków i 14 (10,9%) do braku leczenia. Continue reading „Wynik pediatryczny po rozpoznaniu raka sutka w czasie ciąży”

Ponowna reakcja na kryzotynib za pomocą Lorlatinibu ALK Resistance Mutation L1198F ad 7

Krystaliczne struktury lorlatinibu i kryzotynibu związane z ALK C1156Y i ALK C1156Y-L1198F są pokazane na rysunku S6 w Dodatkowym dodatku. Przeciwnie, L1198 znajduje się w pobliżu miejsca wiążącego ATP, a podstawienie leucyny większą fenyloalaniną prowadzi do sterycznego zderzenia z nitrylem lorlatinibu (Figura 3). Struktury ko-krystaliczne ujawniają, że wiązanie lorlatinibu z mutantem L1198F wymaga, aby sztywny inhibitor makrocykliczny obrócił się od fenyloalaniny, pogarszając oddziaływanie wiązania zawiasów i potencjalnie wprowadzając napięcie do kinazy (Fig. Jest to niekorzystne dla wiązania, ze zmniejszeniem o 1,8 kcal energii wiązania w porównaniu z ALK typu dzikiego w pomiarach obliczeniowych i doświadczalnych wiązania związku (tabele S4 i S5 w dodatkowym dodatku). Jak pokazano na rycinie 3, fenyloalanina nie koliduje z kryzotynibem i faktycznie przesuwa się nieco bliżej inhibitora. Ta bliskość nie zmienia wiązania zawiasowego i może być strukturalnie korzystna, ponieważ wiązanie krizotynibu z L1198F jest bardziej korzystne o 0,8 kcal w stosunku do ALK typu dzikiego (tabele S4 i S5 w dodatkowym dodatku). W komórkach nowotworowych z podwójną mutacją wzmocnione wiązanie spowodowane L1198F prawdopodobnie kompensuje zwiększoną aktywność kinazy spowodowaną C1156Y, prowadząc do uczulenia na krizotynib. Continue reading „Ponowna reakcja na kryzotynib za pomocą Lorlatinibu ALK Resistance Mutation L1198F ad 7”

Perspektywiczne badanie ostrej infekcji HIV-1 u dorosłych w Afryce Wschodniej i Tajlandii

Infekcja ludzkim wirusem niedoboru odporności typu (HIV-1) jest głównym czynnikiem przyczyniającym się do przenoszenia wirusa HIV-1. Znajomość ostrego zakażenia HIV-1 może być ważna w opracowywaniu strategii leczenia w celu eliminacji HIV-1 lub uzyskania funkcjonalnego wyleczenia. Metody
Przeprowadziliśmy dwa razy w tygodniu jakościowe testy kwasu nukleinowego RNA HIV-1 RNA u 2276 ochotników, którzy byli narażeni na wysokie ryzyko zakażenia HIV-1. W przypadku uczestników, u których wykryto ostre zakażenie HIV-1, obserwacje kliniczne, ilościowe pomiary poziomu RNA HIV-1 w osoczu (w celu oceny wiremii) i przeciwciał przeciw HIV oraz wyniki immunofenotypowania limfocytów uzyskano dwa razy w tygodniu.
Wyniki
Pięćdziesięciu z 112 ochotników z ostrą infekcją HIV-1 miało dwie lub więcej próbek krwi pobranych przed wykryciem przeciwciał HIV-1. Mediana szczytowej wiremii (6,7 log10 kopii na mililitr) wystąpiła 13 dni po tym, jak pierwsza próbka wykazała reaktywność w testach na kwas nukleinowy. Reaktywność w teście immunoenzymatycznym wystąpiła po medianie 14 dni. Continue reading „Perspektywiczne badanie ostrej infekcji HIV-1 u dorosłych w Afryce Wschodniej i Tajlandii”